Hægt er að flokka estera út frá þeirri sértæku sýru sem þeir eru fengnir úr. Algengustu eru karboxýlsýruesterar, sem myndast við hvarf karboxýlsýru og alkóhóls-dæmi eru etýlasetat og metýlprópíónat. Auk þessara eru ólífrænir sýruesterar-eins og súlföt og fosföt-sem nýtist verulega í iðnaðar- og efnageirum; dæmi eru díetýlsúlfat og þrífenýlfosfat. Það fer eftir tegund sýru sem um ræðir, eiginleikar, notkun og stöðugleiki esteranna sem myndast eru mismunandi.
Einnig er hægt að flokka estera eftir því hvers konar áfengi er notað við myndun þeirra. Ef þau eru mynduð úr mettuðum alkóhólum, gefa þau venjulega einfalda fitusýruestera, eins og þríglýseríð; öfugt, ef myndaður úr ómettuðum alkóhólum, er niðurstaðan ómettaður ester, eins og glýserýlóleat. Áfengi með sérhæfða uppbyggingu-eins og hringlaga alkóhól eða arómatísk alkóhól-geta einnig hvarfast við sýrur til að framleiða samsvarandi hringlaga eða arómatíska estera; Þessar tegundir estera eru oft notaðar í ilm-, bragðefna- og lyfjaiðnaðinum.
Byggt á uppbyggingu þeirra og notkun er hægt að flokka estera í stórum dráttum í einfalda estera, flókna estera og virka estera. Einfaldir esterar eru almennt myndaðir úr hvarfi mónókarboxýlsýru við einalkóhól og eru almennt notaðir sem leysiefni eða ilmefni. Flóknir esterar-eins og þríglýseríð og fosfólípíð-eru nauðsynlegir þættir náttúrulegra fituefna. Virkir esterar ná yfir þá sem innihalda sérstaka virka hópa-eins og pólýester-og eru mikið notaðir í plast- og trefjaiðnaði. Þessi ýmsu flokkunarkerfi auðvelda dýpri skilning á eiginleikum og fjölbreyttri notkun estera.
